Tra il 1870 e il 1880 vennero sistemati i locali siti in quest'ala del convento del Santo, per accogliere il patrimonio artistico del Museo Civico, arricchito dalle donazioni Capodilista e Bottacin. L'intervento di ristrutturazione, avviato da Eugenio Maestri, fu in seguito portato a termine da Camillo Boito che progettò la facciata e lo scalone monumentale d'accesso. Con l'accrescersi delle collezioni lo spazio divenne insufficiente e, in seguito al trasferimento presso la nuova sede del Museo Civico Eremitani, questi spazi vennero liberati. Sono attualmente destinati all'allestimento di mostre temporanee.